As micotoxinas são metabolitos tóxicos produzidos por fungos e podem ter graves efeitos na saúde dos seres humanos e dos restantes animais. Importantes produtos, como o milho, trigo, arroz, soja e amendoim podem ser contaminados por micotoxinas dependendo das condições de crescimento e condições de armazenamento. Produtos como centeio, aveia, avelãs, figos, uvas ou especiarias também podem ser afetados. O consumo de produtos contaminados por micotoxinas pode levar a graves efeitos tóxicos na saúde dos seres humanos e restantes animais, podendo também ter repercussões crónicas. Além das consequências na saúde esta contaminação tem um impacto direto em factores económicos como a diminuição da eficiência no crescimento de animais de criação, perdas comerciais devido a limitações de importação e exportação e perdas nas receitas do valor das culturas.

Assim, a análise de micotoxinas em alimentos e rações não só é necessária como é muitas vezes exigida pela legislação.